常見細胞污染類型如何辨別及預防解決方法
常見細胞污染類型如何辨別及預防解決方法:細胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有7種,分別是細菌污染,支原體污染,原蟲污染,黑膠蟲污染,真菌污染,病毒污染以及非細胞污染,真菌污染來源,一般是來自實驗服,并且具有氣候性,多雨······
發(fā)布時間:2025-02-19 22:10:30 細胞資源庫平臺 訪問量:34
乙肝病毒(HBV)感染是全球主要公共衛(wèi)生問題之一,有超過2.5億人慢性感染HBV。而其中有超三分之一的人口集中在我國,人數(shù)接近1億人。NTCP工具細胞,特別是外源表達NTCP的肝癌細胞系如HepG2-NTCP和Huh7-NTCP,因其易操作、短周期、重現(xiàn)性佳的特點,在乙肝病毒(HBV)研究中扮演著至關重要的角色。這些細胞模型能夠有效模擬HBV的感染過程,為研究HBV的生命周期、宿主限制因子、病毒復制以及藥物篩選提供了一個強大而便捷的體外平臺。它們不僅有助于揭示HBV感染的分子機制,如DDX3作為宿主限制因子阻礙cccDNA轉(zhuǎn)錄,GPC5作為附著因子在感染入胞過程中的作用,還能通過直接與NTCP相互作用或下調(diào)NTCP表達來篩選和驗證抗病毒藥物的活性,例如環(huán)孢菌素A及其衍生物、雷帕霉素及其衍生物等。此外,這些工具細胞還促進了對HBV宿主特異性分子的發(fā)現(xiàn),為發(fā)展支持HBV感染的小動物模型提供了可能,這對于乙肝相關研究和藥物開發(fā)具有重大意義。
英文標題:Elevated NTCP expression by an iPSC-derived human hepatocyte maintenance medium enhances HBV infection in NTCP-reconstructed HepG2 cells.
中文標題:通過人源iPSC來源的肝細胞維持培養(yǎng)基提高NTCP重構(gòu)的HepG2細胞中HBV感染。
發(fā)表期刊:《Cell & Bioscience》
影響因子:6.1
作者單位:
Center for Vaccines and Immunity, The Abigail Wexner Research Institute
at Nationwide Children’s Hospital, Columbus, OH 43205, USA.
作者信息:
Xinlei Li, Zhaohui Xu, Bidisha Mitra, Minghang Wang, Haitao Guo, Zongdi Feng.
NTCP是HBV的關鍵受體,重構(gòu)的HepG2-NTCP肝癌細胞支持HBV感染但效率不高,未觀察到病毒擴散。全球約有2.57億慢性HBV感染者,但現(xiàn)有抗病毒藥物無法根除病毒。HBV是一種有包膜的病毒,含有約3200個核苷酸的松弛環(huán)狀DNA基因組。由于缺乏有效的細胞培養(yǎng)系統(tǒng)和動物模型,新藥物和治療方法的發(fā)展受限。NTCP表達在增殖或再生的肝細胞中難以維持高水平。
HepG2-NTCP細胞在含有10% FBS、1%青霉素和鏈霉素以及8 μg/ml blasticidin的DMEM培養(yǎng)基中培養(yǎng),而HBV顆粒則從HepDE19細胞培養(yǎng)上清中收集。在試劑方面,HepG2和HepG2-NTCP細胞使用TaKaRa Bio USA提供的Hepatocyte maintenance medium (HMM)進行預處理或長期培養(yǎng),NTCP抗體則由瑞士蘇黎世大學化學和應用生物科學系的Bruno Stieger博士提供。在HBV感染實驗中,HepG2或HepG2-NTCP細胞在接種HBV前24小時用HMM預處理,感染后更換為HMM或D10/2%DMSO培養(yǎng)基。免疫熒光染色方面,不同時間點感染的細胞用4%多聚甲醛固定后,經(jīng)過封閉、滲透、特異性一抗和二抗染色、DAPI復染,并在顯微鏡下觀察。RNA-Seq分析中,HepG2-NTCP細胞用D10/2%DMSO或HMM預處理24小時后提取總RNA,去除rRNA后獲得mRNA片段和cDNA,建庫并在Illumina HiSeq 4000平臺上產(chǎn)生6000萬對端讀長150 bp的測序數(shù)據(jù)。最后,使用DAVID程序?qū)Σ町惐磉_基因進行基因本體(GO)分析,并利用KEGG數(shù)據(jù)庫理解高級生物功能和通路。
圖1. 肝細胞維持培養(yǎng)基(HMM)增強了HepG2-NTCP細胞中的乙型肝炎病毒(HBV)感染。
首先,HepG2-NTCP細胞用100或500基因組當量(GE)/細胞的HBV在含有4%聚乙二醇8000(PEG8000)的DMEM或HMM中稀釋,并在有無10 μM環(huán)孢素A(CsA)的情況下接種。16小時后,移除接種液,細胞被洗滌并重新用含有10% FBS和2% DMSO的DMEM(D10/2% DMSO)或HMM培養(yǎng)。接種后10天,細胞被固定,并使用抗HBc抗體進行免疫熒光染色。細胞核用DAPI染色。其次,HMM在HBV接種前、中或后被加入到HepG2-NTCP細胞培養(yǎng)中(100 GE/細胞)。接種后10天(B)或8天(C),細胞被固定并用抗HBc抗體染色。比例尺=50 μm。使用NIH的ImageJ軟件對HBV感染區(qū)域進行量化,并將數(shù)據(jù)標準化為在常規(guī)培養(yǎng)基(D10/2% DMSO)中用100 GE/細胞的HBV感染的培養(yǎng)值,并以兩個獨立實驗的平均值±標準誤差呈現(xiàn)。
圖2. 肝細胞維持培養(yǎng)基(HMM)處理誘導異位NTCP表達。
A. 在D10/2%DMSO培養(yǎng)基或HMM中培養(yǎng)24或72小時后,通過實時定量PCR(RT-qPCR)檢測HepG2和HepG2-NTCP細胞中NTCP mRNA水平。未處理的D10培養(yǎng)基不含2% DMSO。
B. 在指定培養(yǎng)基中培養(yǎng)24、48或72小時后,HepG2-NTCP或親本HepG2細胞中NTCP蛋白表達的免疫熒光圖像。原代肝細胞維持培養(yǎng)基(PMM)含有10% FBS、1%青霉素/鏈霉素、0.17 μM人類胰島素、10 μM氫化可的松21-半琥珀酸鹽和1.8% DMSO。
C. HepG2-NTCP細胞在接種HBV(500 GE/細胞)前未感染或用HMM或PMM預處理16小時,然后在含有4% PEG 8000的PMM中接種HBV 24小時。移除HBV接種液后,細胞在PMM中維持7天。
D. 在HBV感染后10天,不同HepG2-NTCP克隆中NTCP、HBc(紅色)和HBs(綠色)的表達。本研究中大多數(shù)實驗使用了克隆12。
E. HepG2-NTCP細胞轉(zhuǎn)染含有CMV-IE啟動子或EF1α啟動子控制的GFP編碼質(zhì)粒后,在指定培養(yǎng)基中培養(yǎng)指定時間的GFP表達。比例尺=50 μm。
圖3. 經(jīng)過HMM處理的HepG2-NTCP細胞的轉(zhuǎn)錄組分析顯示,HMM或D10/2%DMSO培養(yǎng)基(對照組)處理24小時后,共鑒定出2727個差異表達基因(DEGs),包括1310個上調(diào)和1417個下調(diào)的DEGs。
與對照組相比,HMM處理組中NTCP的表達增加了6.4倍。KEGG通路分析顯示,HMM激活的前三條通路包括代謝途徑、神經(jīng)活性配體-受體相互作用以及細胞因子-細胞因子受體相互作用。HMM還增強了HepG2-NTCP細胞中的代謝活動,這通過與成熟肝細胞功能相關的KEGG通路得到證實,包括脂質(zhì)代謝、氨基酸合成和外源物質(zhì)代謝。相比之下,下調(diào)的DEGs最豐富的通路包括酒精中毒、癌癥途徑和系統(tǒng)性紅斑狼瘡。在162個與HBV相關的基因(KEGG通路hsa05161)中,上調(diào)的基因包括SOS1、SLC10A1(NTCP)、STAT4和FASLG;而下調(diào)的基因有17個,其中TNF、MAP2K6、E2F1和CCNE2下調(diào)最為顯著。值得注意的是,TNF能夠通過破壞病毒衣殼的完整性來抑制HBV復制,而E2F1或CCNE2的下調(diào)可能導致細胞周期停滯,這可能有利于HBV復制。然而,由于HMM對HBcAg和HBsAg表達的最大效應是在HBV接種前添加HMM實現(xiàn)的,通過NTCP上調(diào)增加HBV進入似乎是HMM增強HBV感染的主要機制。
圖4. HMM與PEG的組合并未導致HepG2-NTCP細胞中HBV的傳播。
在HBV感染前,HepG2-NTCP細胞先用HMM或D10/2%DMSO預處理24小時。接種液移除后,細胞隨后在HMM或D10/2%DMSO培養(yǎng)基中單獨培養(yǎng)或補充4% PEG8000,培養(yǎng)5或10天。通過使用HBc抗體的免疫熒光測定HBV感染率。比例尺=50 μm。
商業(yè)肝細胞維持培養(yǎng)基(HMM)在接種乙型肝炎病毒(HBV)前24小時的短期處理能顯著提高HBV對NTCP重構(gòu)的HepG2細胞的感染效率,這一效果是通過增強CMV啟動子驅(qū)動的NTCP表達實現(xiàn)的。不同克隆的HepG2-NTCP細胞以及不同批次的HMM均顯示出一致的效果,表明該方法也適用于其他使用CMV啟動子驅(qū)動NTCP重構(gòu)的細胞培養(yǎng)系統(tǒng)。HMM能快速誘導HepG2-NTCP細胞中NTCP的表達,但長期培養(yǎng)并不會導致NTCP表達的進一步增加。盡管HMM激活了多種代謝途徑,但其如何增強CMV IE啟動子活性的具體機制尚不清楚,需要進一步研究以確定HMM中提高NTCP表達和HBV感染的活性成分。這項研究提供了一個簡單有效的方法,顯著改善了NTCP重構(gòu)的HepG2細胞中HBV的感染,為HBV的基礎和抗病毒研究開辟了新途徑。
常見細胞污染類型如何辨別及預防解決方法:細胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有7種,分別是細菌污染,支原體污染,原蟲污染,黑膠蟲污染,真菌污染,病毒污染以及非細胞污染,真菌污染來源,一般是來自實驗服,并且具有氣候性,多雨······
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