常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法
常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法:細(xì)胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有7種,分別是細(xì)菌污染,支原體污染,原蟲污染,黑膠蟲污染,真菌污染,病毒污染以及非細(xì)胞污染,真菌污染來源,一般是來自實(shí)驗(yàn)服,并且具有氣候性,多雨······
發(fā)布時(shí)間:2023-05-08 17:37:53 細(xì)胞資源庫(kù)平臺(tái) 訪問量:203
全稱:澳大利亞細(xì)胞培養(yǎng)物保藏中心
官網(wǎng):http://www.cellbankaustralia.com/
細(xì)胞查詢鏈接:http://www.cellbankaustralia.com/ecacc-cell-lines
CellBank Australia 是一個(gè)由位于悉尼韋斯特米德的兒童醫(yī)學(xué)研究所運(yùn)營(yíng)的非盈利組織,是澳大利亞唯一的國(guó)家細(xì)胞系儲(chǔ)存庫(kù),為澳大利亞科學(xué)家提供了獲取經(jīng)過驗(yàn)證的細(xì)胞系和相關(guān)質(zhì)量控制服務(wù)的便捷途徑。
CellBank Australia 還在整個(gè)澳大利亞和新西蘭分發(fā)來自英國(guó)公共衛(wèi)生部歐洲認(rèn)證細(xì)胞培養(yǎng)物保藏中心 (ECACC) 的細(xì)胞系,這是一個(gè)位于英國(guó)的主要國(guó)際細(xì)胞系儲(chǔ)存庫(kù),以及來自日本研究生物資源保藏中心 (JCRB) 的細(xì)胞系,這兩個(gè)集合還包括許多 ATCC 細(xì)胞系。這確保了澳大利亞科學(xué)家可以隨時(shí)使用各種經(jīng)過驗(yàn)證的細(xì)胞系
CellBank Australia 提供多種細(xì)胞系相關(guān)服務(wù),包括 STR 分析、支原體檢測(cè)、培養(yǎng)和返回以及安全存儲(chǔ)。
一、細(xì)胞系認(rèn)證測(cè)試
細(xì)胞系的交叉污染(一種細(xì)胞系被另一種細(xì)胞系污染)是細(xì)胞培養(yǎng)中的常見問題。1960 年代首次與 HeLa 細(xì)胞系相關(guān)聯(lián),交叉污染在各種研究中估計(jì)會(huì)影響 13% 到 36% 的現(xiàn)有細(xì)胞系。雖然使用從存儲(chǔ)庫(kù)和良好細(xì)胞培養(yǎng)規(guī)范獲得的經(jīng)過驗(yàn)證的細(xì)胞系可以最大限度地降低交叉污染的風(fēng)險(xiǎn),但它仍然會(huì)發(fā)生。因此,研究實(shí)驗(yàn)室定期測(cè)試其細(xì)胞系的交叉污染非常重要。
1、人類細(xì)胞系認(rèn)證測(cè)試
為什么要進(jìn)行 STR 分析?
認(rèn)證測(cè)試旨在確認(rèn)或驗(yàn)證細(xì)胞系的身份,證明它來自正確的物種和供體。細(xì)胞系可能因交叉污染、錯(cuò)誤標(biāo)記或其他機(jī)制而被錯(cuò)誤識(shí)別。存在超過 450 個(gè)錯(cuò)誤識(shí)別的細(xì)胞系,但沒有已知的真實(shí)材料。
許多期刊現(xiàn)在要求作者在提交手稿之前驗(yàn)證細(xì)胞系,并在手稿文本中報(bào)告測(cè)試。
短串聯(lián)重復(fù) (STR) 分析被用作一致的測(cè)試方法,允許實(shí)驗(yàn)室和期刊比較細(xì)胞系樣本。STR 分析是一種基于基因型的方法,用于確定細(xì)胞系是否對(duì)應(yīng)于來自同一供體的其他樣本。許多細(xì)胞系沒有其他供體樣本進(jìn)行比較。然而,STR 配置文件數(shù)據(jù)庫(kù)可用于排除與 HeLa 和其他經(jīng)典腫瘤細(xì)胞系的交叉污染。
CellBank Australia 的 STR 分析
CellBank Australia 接受細(xì)胞沉淀和 DNA 樣本進(jìn)行測(cè)試。
STR 基因座使用 PowerPlex? 16HS 系統(tǒng) (Promega) 進(jìn)行擴(kuò)增。使用 GeneMapper? ID 軟件 (ThermoFisher) 分析數(shù)據(jù)。
設(shè)施工作人員對(duì)測(cè)試樣品與參考材料和數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行全面比較。測(cè)試樣品與設(shè)施自己的數(shù)據(jù)集和人類細(xì)胞系 STR 配置文件的國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比較。CellBank Australia 的內(nèi)部數(shù)據(jù)集包含來自澳大利亞和新西蘭九年測(cè)試細(xì)胞系的 1,500 多個(gè) STR 配置文件。
價(jià)格: 每個(gè)樣品166美元,不包括消費(fèi)稅。
2、非人類細(xì)胞系物種鑒定測(cè)試
為什么要進(jìn)行物種測(cè)試?
認(rèn)證測(cè)試旨在確認(rèn)或驗(yàn)證細(xì)胞系的身份,證明它來自正確的物種和供體。
短串聯(lián)重復(fù)序列 (STR) 分析可以在個(gè)體水平上識(shí)別細(xì)胞,并已用于人和小鼠細(xì)胞系。其他基于基因型的方法,例如單核苷酸多態(tài)性 (SNP) 分析,可以確定細(xì)胞系的起源菌株。STR 或 SNP 分析尚未針對(duì)所有實(shí)驗(yàn)室物種開發(fā),由于近親繁殖,數(shù)據(jù)可能難以解釋。
物種檢測(cè)是一種更簡(jiǎn)單的方法,可以應(yīng)用于來自許多不同物種的培養(yǎng)細(xì)胞,包括哺乳動(dòng)物、魚類和昆蟲。該技術(shù)用于檢測(cè)種間交叉污染的情況。大約 10% 的已知錯(cuò)誤識(shí)別細(xì)胞系被交叉污染或與來自不同物種的細(xì)胞混合。一種被稱為“DNA 條形碼”的基于序列的方法越來越多地用于物種檢測(cè),并且是細(xì)胞系的新共識(shí)方法。
CellBank Australia 的 DNA 條形碼
CellBank Australia 接受細(xì)胞沉淀和 DNA 樣本進(jìn)行測(cè)試。
從線粒體基因細(xì)胞色素氧化酶亞基 1 (CO1) 擴(kuò)增共有區(qū)域用于序列分析。數(shù)據(jù)與幾個(gè)序列數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比較,包括 GenBank 和生命條碼數(shù)據(jù)系統(tǒng) (BOLD),其中包含超過 170 萬(wàn)條公共記錄并涵蓋 176,000 種動(dòng)物。
價(jià)格: 每個(gè)樣品150美元,不包括消費(fèi)稅。
批量測(cè)試 8 個(gè)或更多樣品可享受 20% 的折扣。
3、支原體檢測(cè)
支原體污染細(xì)胞系是細(xì)胞培養(yǎng)中的常見問題。雖然公布的數(shù)字各不相同,但估計(jì) 15% 到 35% 的已建立細(xì)胞系被支原體污染。雖然良好的細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)踐降低了支原體污染的發(fā)生率,但它仍然會(huì)發(fā)生,并且很容易傳播。此外,支原體感染可以改變細(xì)胞的各種特性,包括基因活性的變化。由于這些原因,進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng)的研究實(shí)驗(yàn)室必須定期檢測(cè)其細(xì)胞系是否存在支原體感染。有關(guān)此問題的更多信息,請(qǐng)參閱 質(zhì)量問題:污染和無(wú)菌測(cè)試。
為什么要檢測(cè)支原體?
術(shù)語(yǔ)“支原體”是指通常存在于細(xì)胞培養(yǎng)物中的一類細(xì)菌。更準(zhǔn)確地稱為軟體菌,這些細(xì)菌缺乏細(xì)胞壁,使它們對(duì)常用的抗生素如青霉素產(chǎn)生抗藥性。支原體在細(xì)胞培養(yǎng)過程中很容易通過液滴傳播,并且可以以干燥形式存活數(shù)月。
用顯微鏡很難看到支原體污染,需要進(jìn)行特定測(cè)試才能檢測(cè)。污染會(huì)對(duì)實(shí)驗(yàn)工作產(chǎn)生深遠(yuǎn)的影響。根據(jù)存在的物種,支原體生物可以影響細(xì)胞生長(zhǎng)、代謝、致瘤性和對(duì)化療的反應(yīng)(1, 6-7)。
CellBank Australia 的支原體檢測(cè)
對(duì)培養(yǎng)基樣品進(jìn)行支原體檢測(cè)。我們建議細(xì)胞在不含抗生素的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)至少兩周和/或至少傳代兩次。采樣前 3-4 天內(nèi)不應(yīng)更換培養(yǎng)基。抗生素可以抑制細(xì)菌污染,這意味著在抗生素中生長(zhǎng)的細(xì)胞會(huì)增加假陰性結(jié)果的風(fēng)險(xiǎn)。
使用靈敏的內(nèi)部 PCR 方法檢測(cè)支原體 DNA,并使用內(nèi)部對(duì)照檢測(cè) PCR 抑制,這會(huì)影響培養(yǎng)樣品。
MycoAlert? 支原體檢測(cè)試劑盒 (Lonza) 用作基于酶活性檢測(cè)活支原體的第二種方法。
如果結(jié)果不清楚,可以使用第三種測(cè)試方法??梢允褂弥甘炯?xì)胞系進(jìn)行富集,導(dǎo)致可能難以在原始測(cè)試樣品中檢測(cè)到的低水平支原體快速生長(zhǎng)。
價(jià)格: 每個(gè)樣品126美元,不包括消費(fèi)稅。
CellBank Australia 提供一系列與存款相關(guān)的服務(wù),包括將細(xì)胞系轉(zhuǎn)移到 CellBank Australia 以存儲(chǔ)在我們安全的液氮存儲(chǔ)設(shè)施中。
1、目錄存款
研究科學(xué)家可以通過我們的目錄存入服務(wù)將他們的新型細(xì)胞系存入 CellBank Australia,從而更廣泛地用于研究目的。保藏的細(xì)胞系在供全球分發(fā)之前要經(jīng)過短串聯(lián)重復(fù) (STR) 分析和其他質(zhì)量控制檢查,保藏者無(wú)需支付任何費(fèi)用。
為什么要在 CellBank Australia 存款?
保藏者可以確保從他們的細(xì)胞系中生成 STR 譜,以確保它們確實(shí)是獨(dú)一無(wú)二的。在確定該線路的未來通道是否會(huì)受到交叉污染時(shí),這些配置文件是有價(jià)值的參考。
存款人可以將感興趣方的細(xì)胞系請(qǐng)求提交給 CellBank Australia 或其分銷合作伙伴。這消除了培養(yǎng)、冷凍和運(yùn)輸細(xì)胞系的需要,節(jié)省了員工成本和工作量。保藏者還可以通過使用他們保藏的細(xì)胞系來預(yù)期科學(xué)引用的增加。
CellBank Australia 細(xì)胞系的接收者同意在所有引用該材料的出版物和專利申請(qǐng)中承認(rèn)其保藏人(或他們的發(fā)起人,如果不是同一人)。
接收者可以直接從 CellBank Australia 或歐洲認(rèn)證細(xì)胞培養(yǎng)物保藏中心(ECACC;英國(guó))及其渠道合作伙伴和分銷商 Sigma-Aldrich(全球分銷)和 Dainippon Sumito Pharma(DSP;日本)接收 CellBank Australia 的細(xì)胞系. 因此,在 CellBank Australia 位于悉尼的辦公場(chǎng)所之外,CellBank Australia 的細(xì)胞系可從德國(guó)、日本、英國(guó)和美國(guó)的分銷中心獲得。
根據(jù)購(gòu)買時(shí)達(dá)成的協(xié)議條款,細(xì)胞不能用于人體,未經(jīng)保存人同意,不得用于商業(yè)目的。
我們的目錄存放服務(wù)是免費(fèi)提供的。
2、專利押金
通過我們的專利保藏服務(wù),CellBank Australia 接受人類和動(dòng)物細(xì)胞系和雜交瘤進(jìn)行儲(chǔ)存,以補(bǔ)充國(guó)際專利局對(duì)發(fā)明的書面披露。
CellBank Australia 的安全存儲(chǔ)服務(wù)是研究科學(xué)家將與短期或長(zhǎng)期異地存儲(chǔ)部分樣本相關(guān)的成本外包的一種方式,作為其主要存儲(chǔ)的備份。該服務(wù)并非旨在取代研究科學(xué)家自己的液氮或 -80°C 冷凍庫(kù)。
送往 CellBank Australia 進(jìn)行安全存儲(chǔ)的材料與存儲(chǔ)庫(kù)自己的樣本一起保存在三個(gè)液氮存儲(chǔ)系統(tǒng)和一個(gè)超低溫冰箱中,所有這些系統(tǒng)都連接到一個(gè)警報(bào)系統(tǒng),可連續(xù)監(jiān)控存儲(chǔ)溫度。停電時(shí),報(bào)警系統(tǒng)和存儲(chǔ)系統(tǒng)都連接到備用發(fā)電機(jī)。儲(chǔ)存通常低于-150 攝氏度的液氮汽相或低于-80 攝氏度的冰箱。
包含在服務(wù)中
在液氮?dú)庀嘀袃?chǔ)存,儲(chǔ)存溫度始終低于 -150 攝氏度
或儲(chǔ)存在超低溫冰箱中,儲(chǔ)存溫度始終低于-80攝氏度
每周 7 天,每天 24 小時(shí),通過帶有遠(yuǎn)程警報(bào)的建筑物范圍的警報(bào)系統(tǒng)監(jiān)控存儲(chǔ)溫度
發(fā)生電源故障時(shí)基于發(fā)電機(jī)的備用電源系統(tǒng)
定制的、條形碼驅(qū)動(dòng)的數(shù)據(jù)庫(kù),用于跟蹤具有唯一標(biāo)識(shí)號(hào)的安瓿。
我們現(xiàn)在提供 10X Chromium 3' 基因表達(dá)服務(wù)。
該服務(wù)包括
細(xì)胞計(jì)數(shù)和活力處理
使用 Gel Bead-In Emulsion (GEM) 技術(shù)進(jìn)行細(xì)胞分離和條形碼
后 GEM RT 凈化和 cDNA 擴(kuò)增
基因表達(dá)文庫(kù)構(gòu)建,這種鉻單細(xì)胞基因表達(dá)解決方案使研究人員能夠
識(shí)別和表征稀有細(xì)胞類型
分析和了解細(xì)胞異質(zhì)性及其對(duì)您的生物系統(tǒng)的影響
評(píng)估同一細(xì)胞內(nèi)的 mRNA 和細(xì)胞表面蛋白表達(dá)譜
常見細(xì)胞污染類型如何辨別及預(yù)防解決方法:細(xì)胞培養(yǎng)中常見的生物污染類型有7種,分別是細(xì)菌污染,支原體污染,原蟲污染,黑膠蟲污染,真菌污染,病毒污染以及非細(xì)胞污染,真菌污染來源,一般是來自實(shí)驗(yàn)服,并且具有氣候性,多雨······
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